Quando Alien di Ridley Scott uscì per la prima volta nel 1979, il franchise era un film horror viscerale con un'estetica di fantascienza. Era una premessa grintosa e relativamente semplice che è stata eseguita magistralmente, ottenendo un plauso istantaneo. Il franchise si basò su questo successo espandendo il suo raggio d'azione, aumentando lo spettacolo d'azione e l'orrore militarizzando la dinamica di base in Aliens di James Cameron. Prometeo allargò ulteriormente la portata, osando porre domande sulla natura della creazione. Alien: Covenant sta cercando di fondere le due metà di questo franchise in più di un modo, schizzando lo schermo di sangue mentre si espande sulla complessa mitologia della sua omonima creatura, e infine risponde da dove provengono.
Gli eventi di Prometeo sembravano suggerire che lo xenomorfo fosse almeno in parte una creazione dei misteriosi ingegneri. Tuttavia, il regista di ritorno Scott ha smentito questa teoria, prendendo in giro i fan prima dell'uscita del sesto film in franchising.
In un'intervista con Collider (tramite IBT), Scott ha discusso della natura di Alien: Covenant, e perché ora è il momento giusto per rispondere a una domanda che ha infastidito i fan dall'originale pubblicato oltre 30 anni fa:
"Non avrebbe dovuto davvero finire, quindi siamo tornati con un'idea molto semplice: chi li ha creati? [Alien] era praticamente lì, esiste. Ed è quello che è …
Quindi abbiamo reinventato l'idea di Alien, penso, che è che il Patto ci avvicina a chi e perché questa cosa è stata progettata per rendere gli esseri umani. E se pensi che siano loro [gli ingegneri], ti sbagli di grosso."
I commenti sinceri di Scott prendono in giro una trama molto più ampia rispetto all'originale, con il suggerimento che questo film porterà gli spettatori a un "passo più vicino" alla comprensione della natura delle creature, suggerendo che il pubblico non riceverà tutte le risposte questa volta. Il sequel di Covenant è già stato scritto, quindi è probabile che questa domanda chiave si collochi a cavallo tra i due film. Sebbene ciò possa frustrare i fan che speravano in risposte concrete, sono iniziate a circolare voci sulla catena evolutiva che collega gli umani, gli ingegneri e gli xenomorfi.
C'è un suggerimento (pubblicato su Alien-Covenant.com) che un potere superiore abbia seminato umani, ingegneri e 3-4 altre iterazioni di umanoidi in molti universi. Questi esseri superiori presumibilmente hanno poteri simili a Dio, incluso il potere di provocare disastri naturali su vasta scala al fine di cambiare e ripristinare gli ecosistemi. L'orrore di uno xenomorfo che raggiunge la terra è stato preso in giro per tutto il franchise con il consenso generale sul fatto che una tale eventualità porterebbe a un evento di estinzione. Se questi esseri superiori esistessero, tuttavia, avrebbero potuto creare lo xenomorfo come una forma di giustizia divina. A questo punto, però, i fan dovranno aspettare per scoprirlo.
